Haplogroup P1 (P-M45), the immediate ancestor of Haplogroup R, likely emerged in Southeast Asia.[6] The SNP M207, which defines Haplogroup R, is believed to have arisen during the Upper Paleolithic era, about 27,000 years ago.[2][1]
Only one confirmed example of basal R* has been found, in 24,000 year old remains, known as MA1, found at Mal'ta–Buret' culture near Lake Baikal in Siberia.[2] (While a living example of R-M207(xM17,M124) was reported in 2012, it was not tested for the SNP M478; the male concerned – among a sample of 158 ethnic Tajik males from Badakshan, Afghanistan – may therefore belong to R2.)
It is possible that neither of the primary branches of R-M207, namely R1 (R-M173) and R2 (R-M479) still exist in their basal, undivergent forms, i.e. R1* and R2*. No confirmed case, either living or dead, has been reported in scientific literature. (Although in the case of R2*, relatively little research has been completed.)
Despite the rarity of R* and R1*, the relatively rapid expansion – geographically and numerically – of subclades from R1 in particular, has often been noted: "both R1a and R1b comprise young, star-like expansions" (Karafet 2008).
The wide geographical distribution of R1b, in particular, has also been noted. Hallast et al. (2014) mentioned that living examples found in Central Asia included:
the "deepest subclade" of R-M269 (R1b1a1a2) – the most numerous branch of R1b in Western Europe, and;
the rare subclade R-PH155 (R1b1b) found only in one Bhutanese individual and one Tajik.
(While Hallast et al. suggested that R-PH155 was "almost as old as the R1a/R1b split", [8] R-PH155 was later discovered to be a subclade of R-L278 (R1b1) and has been given the phylogenetic name R1b1b.)
Предполагается, что гаплогруппа R могла зародиться где-нибудь в Центральной Азии 31,9 тыс. лет назад (между 24 000 и 34 300 лет назад по Karafet 2008) от субклады P1 (M45), известной как K2b2a, гаплогруппы P (K2b2) (Wells 2001). Последний общий предок современных носителей гаплогруппы R жил 28 200 лет назад (даты определены по снипам компанией YFull[7]).
Древнейшая известная гаплогруппа R* была обнаружена в останках мальчика MA-1 с южносибирской стоянки Мальта́, жившего около 24 тыс. лет назад[1].
В настоящее время большинство разновидностей гаплогруппы R найдено среди населения Средней Азии, Сибири и Индийского субконтинента. Одна изолированная подгруппа, принадлежащая к гаплогруппе R (R1b), была найдена среди коренного населения северного Камеруна на западе Центральной Африки. Как полагают, эта подгруппа возникла в результате доисторического перемещения древнего евразийского населения обратно в Африку.
Гаплогруппа R (также как и N, Q, M, S) имеет свои «корни» на уровне гаплогруппы K(xLT) (субклада K2b2a) которая по реконструкции наибольшего разнообразия смежных линий указывает на Центральную Азию.
