According to http://kramerius.cbvk.cz/search/i.jsp?pid=uuid:235926a7-e533-11eb-b... there were 86 Jewish individuals there in 1922.
I had a look at the census of 1921 and made a list of all Jewish households and wrote down their heads (plus of those who could possibly be Jewish).
=== Vodňany - Město (čp. 1-90) ===
Terezie (Theresia) Kozíčková (Kozíček) 1848
https://digi.ceskearchivy.cz/634511/5
Viktor Danzer 1888
https://digi.ceskearchivy.cz/634511/6
→ Victor Danzer
(also Artur? Gans 1889)
Růžena (Rosalie) Holubová (Holub) 1854
https://digi.ceskearchivy.cz/634511/10
Berthold Holub 1876
https://digi.ceskearchivy.cz/634511/11
→ Berthold Holub
Albína Richterová (Richter) 1866
https://digi.ceskearchivy.cz/634511/59
Adolf Kauder 1857
https://digi.ceskearchivy.cz/634511/102
→Adolf Kauder
(1910: https://digi.ceskearchivy.cz/634212/158)
Arnošt (Ernst) Lederer 1883
https://digi.ceskearchivy.cz/634511/115
→Ernst Lederer
Jakub (Jakob) Rubín 1852
https://digi.ceskearchivy.cz/634511/125
(→ probably NOT him: Jakub Rubin)
=== Vodňany - Město (čp. 91-204) ===
Karolína Steinová (Stein) 1854
https://digi.ceskearchivy.cz/634512/112
Teresie (Theresia) Steinová (Stein) 1859
https://digi.ceskearchivy.cz/634512/113
=== Vodňany - Město (čp. 14-130) ===
Josef Rubín 1866
https://digi.ceskearchivy.cz/634513/16
(Emilie Kaudrová 1871)
https://digi.ceskearchivy.cz/634513/22
Rudolf Lederer 1888
https://digi.ceskearchivy.cz/634513/33
→ Rudolf Lederer
David Kantor 1856
https://digi.ceskearchivy.cz/634513/54
Hynek (Heinrich) Kohn 1859
https://digi.ceskearchivy.cz/634513/95
(also Antonie Reinischová 1849 and Josefa Klauberová 1902)
=== Vodňany - Město (čp. 131-203) ===
(Emil Fluss 1896 → Emil Fluss Leo Lewy 1880)
https://digi.ceskearchivy.cz/119833/5
Josefina Fröhlichová (Fröhlich) 1854
https://digi.ceskearchivy.cz/119833/56
(Also Leopold Bloch 1881)
Dr. Adolf Brok 1854
https://digi.ceskearchivy.cz/119833/64
→ Dr. Adolf Brok
Kateřina (Katharina) Lövyová (Löwy) 1858
https://digi.ceskearchivy.cz/119833/65
Ottilia Presserová (Presser) 1887
https://digi.ceskearchivy.cz/119833/78
(formely Vilém [Wilhelm] Presser 1861)
(Rabbi) Josef Stimmer 1846
https://digi.ceskearchivy.cz/119833/82
Karolina Holubová (Holub) 1861
https://digi.ceskearchivy.cz/119833/83
Josef Kohn 1863
https://digi.ceskearchivy.cz/119833/114
David Schönberger 1854
https://digi.ceskearchivy.cz/119833/124
(also Rudolf Gans 1885)
https://digi.ceskearchivy.cz/119833/145
Betty Blahová (Blaha) 1860
https://digi.ceskearchivy.cz/119833/171
(also Luise Arnsteinová 1873)
Marie? Ehrlichová (Ehrlich) 1848
https://digi.ceskearchivy.cz/119833/221
(connection to factory owner David Ehrlich in Vienna?)
=== Vodňany - Předměstí (čp. 1-70) ===
Bernard (Bernhard) Kohn 1830
https://digi.ceskearchivy.cz/634514/1
Šimon (Simon) Schmitz 1868
https://digi.ceskearchivy.cz/634514/41
→Simon Schmitz
Jindriska Broková 1847
https://digi.ceskearchivy.cz/634514/56
→ Henriette Brok
(Karel Raffel 1900)
https://digi.ceskearchivy.cz/634514/197
=== Vodňany - Předměstí (čp. 71-92, 94-104, 320, 323-328, 332-336, 339, 400-407, 417, 420-421, 423-430, 436-450, 453) ===
Herman Karpeles 1865
https://digi.ceskearchivy.cz/634515/26
(Jan/Johann Polak 1849)
https://digi.ceskearchivy.cz/634515/114
Vilém (Wilhelm) Karpeles 1869
https://digi.ceskearchivy.cz/634515/219
→Wilhelm /Vilém Karpeles
=== Vodňany - Předměstí (čp. 105-250) ===
Žofie (Sofie) Skalová (Skala) 1860
https://digi.ceskearchivy.cz/119834/35
(Widow of Simon?)
=== Vodňany - Předměstí (čp. 251-311, 314, 338, 340-341, 344-345, 347-349, 351, 354-355, 364-365, 367-370, 380, 382-383, 418-419, 434, 454, dům bez čp.) ===
Aloisa Perelesová (Pereles) 1855
https://digi.ceskearchivy.cz/634517/49
(also Josefa Fröhlichová/Fröhlich 1848)
=== Vodňany - Předměstí (čp. 136-213, 315-317, 319, 321, 329-331, 337, 342-343) ===
None (there are some families with the Polánský surname, all Catholic though)
=== Vodňany - Předměstí (čp. 352-353, 356-359, 366, 381, 385-356, 389-396, 408-410, 413-416, 422, 431-433, 435, 446, 451-452, 455-457) ===
Josef Reich 1875
https://digi.ceskearchivy.cz/634519/4
(František Černý 1867)
https://digi.ceskearchivy.cz/634519/35
I hope it helps someone. (Though, I myself did not come closer to my goal of finding more Kafkas related to me.)