Bonjer, Bonier, Bonnier, zijn allemaal namen die vaak gebruikt worden of verkeerd geschreven zijn. De oorspronkelijke naam is Bonier-Bonjer. Beide zijn mogelijk. Het is een oud-Frankisch (germaans!) woord voor Bunder, een oude oppervlakte maat. Zijn origine stamt waarschijnlijk ergens in de Zuiderlijke Lage Landen.
Gezien het feit dat de meeste mannelijke Bonjers Kapiteins (schippers) op de grote vaart waren, is het waarschijnlijk dat het gezegde: "Zoek je Bonje" bij ons vandaan komt. Het originele gezegde is: "Bonje(r) in de kajuit". En heeft zijn (waarschijnlijke) oorsprong in Amsterdam. (De 'r' wordt in het Amsterdamse Bargoens vaak niet uitgesproken). Het gezegde binnen bepaalde takken van de familie is: "Wij zijn niet naar ruzie genoemd, we hebben het opnieuw gedefinieerd". Verder onderzoek is nodig ;-)